More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11754 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11754  nitrate reductase narX  100 
 
 
652 aa  1315    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0308508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  85.05 
 
 
1232 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4546  nitrate reductase, alpha subunit  92.19 
 
 
1233 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159168  normal  0.282188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2156  nitrate reductase, alpha subunit  89.58 
 
 
1233 aa  475  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0115159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  89.96 
 
 
1227 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  89.96 
 
 
1227 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  89.96 
 
 
1227 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3675  nitrate reductase, alpha subunit  86.4 
 
 
1225 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381887  normal  0.0436101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0900  nitrate reductase, alpha subunit  87.8 
 
 
1225 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5441  Nitrate reductase  81.53 
 
 
1221 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3699  nitrate reductase, alpha subunit  79.54 
 
 
1234 aa  419  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.450171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  74.73 
 
 
1181 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0314  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  82.38 
 
 
1236 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2803  nitrate reductase, alpha subunit  76.71 
 
 
1259 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5213  nitrate reductase subunit alpha  81.55 
 
 
1216 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598357  normal  0.703805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1824  nitrate reductase, alpha subunit  76.1 
 
 
1255 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1346  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  75.39 
 
 
1240 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4429  nitrate reductase, alpha subunit  70.82 
 
 
1225 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102054  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3138  nitrate reductase, alpha subunit  78.12 
 
 
1221 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000648615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4478  nitrate reductase, alpha subunit  69.18 
 
 
1242 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.397218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1763  nitrate reductase, alpha subunit  73 
 
 
1237 aa  392  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0373025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2040  nitrate reductase, alpha subunit  67.55 
 
 
1222 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4543  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  77.41 
 
 
243 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.290259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0510  molybdopterin oxidoreductase  65.69 
 
 
596 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.464423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  76.15 
 
 
243 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18720  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  63.25 
 
 
1256 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  75.83 
 
 
243 aa  372  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  74.9 
 
 
243 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1260  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  74.48 
 
 
243 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0903  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  75 
 
 
243 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1277  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  74.48 
 
 
243 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0192  nitrate reductase, alpha subunit  66.26 
 
 
1232 aa  350  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0177  nitrate reductase, alpha subunit  65.43 
 
 
1232 aa  348  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.151114  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11189  respiratory nitrate reductase gamma subunit narI  68.62 
 
 
246 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1205  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  70.82 
 
 
1216 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  59.62 
 
 
1227 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1491  nitrate reductase, alpha subunit  62.83 
 
 
1248 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1235  nitrate reductase, alpha subunit  68.22 
 
 
1241 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.177999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2635  nitrate reductase, alpha subunit  59.62 
 
 
1082 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1907  nitrate reductase, alpha subunit  59.18 
 
 
1272 aa  324  3e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3180  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  58.68 
 
 
1227 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2275  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  59.09 
 
 
1227 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2135  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  58.68 
 
 
1227 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1977  respiratory nitrate reductase subunit alpha  59.09 
 
 
1227 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1954  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  59.09 
 
 
1227 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2125  respiratory nitrate reductase subunit alpha  59.09 
 
 
1227 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.652044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0499  nitrate reductase, alpha subunit  61.57 
 
 
1293 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.238766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2158  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  59.09 
 
 
1227 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1932  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  59.09 
 
 
1227 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1971  nitrate reductase, alpha subunit  58.68 
 
 
1227 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  59.24 
 
 
1227 aa  319  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01202  nitrate reductase 1, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1375  nitrate reductase, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0266842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1708  nitrate reductase 1, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0699868  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2399  nitrate reductase, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000859704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1334  nitrate reductase, alpha subunit  59.35 
 
 
1247 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00293612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1559  nitrate reductase 1 subunit alpha  58.94 
 
 
1247 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.468525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1376  nitrate reductase 1, alpha subunit  58.94 
 
 
1247 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0697293  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1959  nitrate reductase 1 subunit alpha  58.94 
 
 
1247 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3399  nitrate reductase, alpha subunit  58.65 
 
 
1227 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1895  nitrate reductase 1, alpha subunit  58.94 
 
 
1247 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.5069  normal  0.259133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1900  nitrate reductase 1, alpha subunit  58.54 
 
 
1247 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0962174  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2315  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  58.54 
 
 
1247 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54501  normal  0.661113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1234  nitrate reductase subunit alpha  59.68 
 
 
1261 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.251816  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3592  nitrate reductase, alpha subunit  66.36 
 
 
1245 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.292866  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4669  nitrate reductase, alpha subunit  66.36 
 
 
1245 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00847712  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  59.27 
 
 
1261 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2074  respiratory nitrate reductase subunit alpha apoprotein  64.49 
 
 
1252 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393838  normal  0.347657 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0974  respiratory nitrate reductase alpha chain oxidoreductase protein  65.42 
 
 
1245 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5002  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  64.93 
 
 
1244 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1584  nitrate reductase, alpha subunit  57.72 
 
 
1246 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  56.75 
 
 
1246 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1765  nitrate reductase subunit alpha  56.75 
 
 
1246 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  57.32 
 
 
1246 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  62.78 
 
 
1260 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1694  nitrate reductase, alpha subunit  57.72 
 
 
1246 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  57.72 
 
 
1246 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  57.72 
 
 
1246 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  57.72 
 
 
1256 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  57.72 
 
 
1246 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  57.72 
 
 
1246 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  57.32 
 
 
1246 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2564  nitrate reductase, alpha subunit  57.32 
 
 
1253 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  57.32 
 
 
1246 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1853  nitrate reductase, alpha subunit  61.71 
 
 
1257 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  57.32 
 
 
1246 aa  307  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1854  nitrate reductase, alpha subunit  65.88 
 
 
1341 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0605  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  59.83 
 
 
1252 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2681  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1241 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1731  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1248 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2757  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1248 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3077  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1241 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.49471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1514  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1241 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2625  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1241 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2241  nitrate reductase, alpha subunit  65.4 
 
 
1241 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2259  nitrate reductase, alpha subunit  56.91 
 
 
1268 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2883  nitrate reductase, alpha subunit  61.26 
 
 
1240 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.912631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2792  nitrate reductase, alpha subunit  60.16 
 
 
1272 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  57.32 
 
 
1246 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>