More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0130 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 320 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  57.59 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.86 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.89 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  53.85 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  56 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 		 333 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.76 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.15 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.76 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  41.05 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.43 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  40.12 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  43.48 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.03 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.94 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.12 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  39.2 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  38.58 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.27 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.89 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.06 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  39.41 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.89 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  40.06 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  39.32 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.31 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.13 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.88 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.12 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  38.25 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.49 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.15 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.39 
 
 		 324 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.25 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.23 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  39.08 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  38.63 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.11 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  42.28 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.21 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  41.8 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  41.08 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  37.35 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.39 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.22 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  40.76 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.06 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  38.01 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.22 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.39 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  38.82 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>