50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2171 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2171  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1460    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.201556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 1400 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1444 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 1312 aa  64.3  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 1314 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.67 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 1067 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 987 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  24.44 
 
 		 401 aa  55.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 394 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 746 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 385 aa  54.3  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 1008 aa  54.3  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 1313 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 894 aa  53.9  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 1287 aa  51.2  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 1035 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25.58 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 1185 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 418 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 346 aa  48.5  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 597 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  25.94 
 
 		 1673 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 378 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 401 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  21.98 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.11 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 409 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 1271 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 1265 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 379 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 1256 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 536 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 375 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  23.34 
 
 		 420 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 414 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 360 aa  45.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  29.82 
 
 		 406 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 1152 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 820 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 		 360 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 1239 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 379 aa  44.3  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 404 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 400 aa  43.9  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  22.02 
 
 		 431 aa  43.9  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>