More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0317 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0317  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
412 aa  839    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1238  phosphopyruvate hydratase  41.52 
 
 
399 aa  299  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0269963  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0197  phosphopyruvate hydratase  38.81 
 
 
413 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000900243  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0429  enolase  37.75 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2216  phosphopyruvate hydratase  39.51 
 
 
395 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2598  phosphopyruvate hydratase  37.16 
 
 
401 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2545  enolase  36.59 
 
 
401 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0053  phosphopyruvate hydratase  35.63 
 
 
417 aa  265  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0387594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0022  enolase  36.45 
 
 
411 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2379  phosphopyruvate hydratase  39.22 
 
 
395 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00363465  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2515  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 
401 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1809  phosphopyruvate hydratase  37.38 
 
 
395 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0056  phosphopyruvate hydratase  34 
 
 
419 aa  255  8e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2893  phosphopyruvate hydratase  37.84 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00235502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1825  phosphopyruvate hydratase  37.5 
 
 
400 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1303  Phosphopyruvate hydratase  34.49 
 
 
401 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.50903  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1098  phosphopyruvate hydratase  34.89 
 
 
417 aa  246  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2850  phosphopyruvate hydratase  36.25 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.647479  hitchhiker  0.00365669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  36.14 
 
 
430 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  35.75 
 
 
426 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  34.93 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  35.51 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  35.49 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  34.22 
 
 
426 aa  232  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  34.78 
 
 
430 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  35.02 
 
 
428 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  35.27 
 
 
426 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  34.06 
 
 
432 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  34.14 
 
 
427 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  34.31 
 
 
428 aa  229  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  35.42 
 
 
431 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  35.27 
 
 
430 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  34.46 
 
 
429 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  34.46 
 
 
429 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  36.17 
 
 
434 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  34.46 
 
 
429 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  34.22 
 
 
425 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  33.98 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  34.35 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  34.78 
 
 
428 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  35.99 
 
 
426 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  36.39 
 
 
429 aa  226  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  35.44 
 
 
426 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0112  phosphopyruvate hydratase  35.61 
 
 
438 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  33.82 
 
 
427 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  33.49 
 
 
428 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  34.88 
 
 
430 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  33.41 
 
 
425 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  34.29 
 
 
431 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1631  enolase  34.79 
 
 
429 aa  223  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  33.73 
 
 
428 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  33.66 
 
 
425 aa  222  9e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  33.49 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  31.37 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  33.02 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2015  phosphopyruvate hydratase  34.06 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  34.3 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  34.47 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  33.25 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2706  phosphopyruvate hydratase  33.98 
 
 
428 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  34.05 
 
 
431 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  31.88 
 
 
428 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  34.05 
 
 
431 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  33.09 
 
 
425 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  34.47 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3517  phosphopyruvate hydratase  35.77 
 
 
429 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0826419  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0662  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 
431 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  32.93 
 
 
427 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  34.3 
 
 
427 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  34.2 
 
 
435 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  34.05 
 
 
431 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1894  enolase  35.47 
 
 
419 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2020  phosphopyruvate hydratase  33.58 
 
 
422 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  32.93 
 
 
429 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  34.05 
 
 
431 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4022  phosphopyruvate hydratase  34.06 
 
 
430 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  33.01 
 
 
430 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  33.98 
 
 
433 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  34.79 
 
 
433 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  32.13 
 
 
432 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  34.06 
 
 
429 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  34.2 
 
 
438 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  33.89 
 
 
433 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  35.53 
 
 
424 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  32.85 
 
 
428 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  33.41 
 
 
425 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  34.79 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  34.13 
 
 
432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  32.85 
 
 
429 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  32.13 
 
 
427 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  33.57 
 
 
427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  34.57 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  33.33 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  35.27 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>