More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2706 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2706  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
428 aa  867    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  70.05 
 
 
426 aa  612  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0844  Phosphopyruvate hydratase  70.33 
 
 
429 aa  587  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.35 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
434 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
431 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
430 aa  565  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.64 
 
 
432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
428 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
429 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
428 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  66.51 
 
 
435 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
434 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
434 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
434 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
429 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
431 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
429 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
435 aa  552  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
426 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 
429 aa  551  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
429 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 
425 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
430 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
426 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
425 aa  550  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 
427 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.8 
 
 
428 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.88 
 
 
426 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
431 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  65.64 
 
 
429 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.64 
 
 
429 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 
437 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 
425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
429 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
429 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
429 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 
433 aa  547  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
431 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.37 
 
 
429 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 
429 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 
425 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
425 aa  541  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  61.28 
 
 
432 aa  542  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
425 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 
430 aa  538  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.71 
 
 
422 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  61.65 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
425 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
424 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.27 
 
 
431 aa  536  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  63.74 
 
 
426 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 
425 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  64.85 
 
 
428 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
427 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
429 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
427 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
433 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  65.64 
 
 
425 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  64.62 
 
 
428 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
437 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  63.44 
 
 
428 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  62.09 
 
 
427 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.03 
 
 
429 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  62.71 
 
 
423 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
427 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  60.71 
 
 
428 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 
431 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  62.95 
 
 
427 aa  532  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
427 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  63.03 
 
 
427 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
430 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  61.97 
 
 
430 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  62.82 
 
 
427 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 
425 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 
428 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  63.33 
 
 
427 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 
431 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  61.05 
 
 
430 aa  528  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  62.32 
 
 
430 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 
424 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 
424 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
427 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.09 
 
 
428 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  62.09 
 
 
428 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 
429 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>