97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2763 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2763  glycosyltransferases-like  100 
 
 
307 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2736  glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 
289 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3133  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2761  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0864434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3096  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3156  glycosyltransferase  39.81 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1844  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0724124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1982  glycosyl transferase, putative  39.81 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0931  putative glycosyl transferase  39.81 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1477  putative glycosyl transferase  38.89 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
613 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
613 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
623 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  31.76 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  32.39 
 
 
642 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
841 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
326 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
291 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  23.5 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1319  glycosyl transferase family protein  44.64 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.362046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.65 
 
 
838 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0724  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
253 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  38.33 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3458  glycosyltransferases-like protein  23.4 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190923  normal  0.0113746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
822 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
310 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2327  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  39.71 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
247 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1228  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
276 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
1106 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  36.23 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0348  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
841 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
359 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  30.68 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  30.68 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
742 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4734  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  33.33 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 
505 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  34.48 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  40.38 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  30.84 
 
 
288 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
742 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4212  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.979842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>