123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1655 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1655  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
292 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4300  hypothetical protein  55.06 
 
 
271 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54030  hypothetical protein  53.73 
 
 
271 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4728  hypothetical protein  53.36 
 
 
271 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3733  hypothetical protein  55.12 
 
 
277 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0289264  normal  0.0233298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1421  protein of unknown function DUF81  45.02 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  32.23 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  32.86 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.84 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.26 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.47 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  34.48 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31.37 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  32.09 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.84 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.84 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.63 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.34 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  30.29 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.71 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  30.89 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  27.49 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  27.45 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  28.65 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.64 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  32.39 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  33.71 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  26.44 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  30.73 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  27.47 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  29.28 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  32.85 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  28.78 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  29.65 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  29.39 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.48 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  28.66 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  32.69 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.18 
 
 
264 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  27.01 
 
 
264 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 
261 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 
268 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 
265 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  26.77 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0864  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  32.31 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  26.14 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  29.8 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  35.23 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  27.04 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  25.96 
 
 
268 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  28.73 
 
 
265 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  26.98 
 
 
267 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  26.56 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  27.6 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.99 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  27.69 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  30.33 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  32.7 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  25.64 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  27.17 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  28.38 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  26.88 
 
 
272 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  26.86 
 
 
241 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  22.86 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  29.46 
 
 
272 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  27.09 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  29.33 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.59 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.84 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  33.11 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  22.52 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  27.81 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.33 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  32.3 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.16 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  27.41 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1422  hypothetical membrane spanning protein  26.22 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  26.56 
 
 
257 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  24 
 
 
265 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  23.75 
 
 
268 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  24.86 
 
 
272 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1485  hypothetical protein  26.22 
 
 
263 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.156488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  29.8 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  21.26 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>