124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3967 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3967  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0622201  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  59.42 
 
 
283 aa  324  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0294  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  52.01 
 
 
274 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383352  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0265  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  51.84 
 
 
274 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0369  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.09 
 
 
283 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  46.38 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5160  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.88 
 
 
280 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543239  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3078  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.29 
 
 
280 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1193  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  47.73 
 
 
278 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233071  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1960  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44.09 
 
 
280 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  32.97 
 
 
271 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  31.9 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  32.6 
 
 
291 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  32.6 
 
 
291 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  32.6 
 
 
291 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  29.2 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  27.66 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  30.4 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.64 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  32.23 
 
 
272 aa  92  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  29.35 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  29.35 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  29.35 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  29.35 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  29.96 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  29.35 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  29.35 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  30.04 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  30.04 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  30.04 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  30.04 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  30.04 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  28.99 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  29.14 
 
 
331 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  30.85 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  30.07 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  30.32 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  30.08 
 
 
293 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  28.41 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  29.96 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  26.79 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  26.79 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  27.51 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.12 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.68 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  28.47 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.43 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  30.96 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.09 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  28.99 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  31.88 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  28.2 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  26.81 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  27.47 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.91 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  28.03 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  30.63 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  29.64 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  28.2 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  29.86 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  29.17 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  26.43 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  26.43 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  29.17 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  28.93 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  28.26 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  29.96 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.29 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  27.21 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  30.48 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  30.86 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  25.63 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  29.24 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  27.17 
 
 
263 aa  79  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.52 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  29.09 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  27.54 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  28.36 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.15 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  30.86 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  28.42 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  28.17 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  27.66 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  27.69 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  25.9 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  25.81 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  25.36 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  29.15 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  26.62 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  25.83 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  27.57 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.51 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  27.18 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  26.71 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  26.59 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  27.01 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>