180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1557 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  76.63 
 
 
263 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  77.1 
 
 
265 aa  418  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  77.39 
 
 
265 aa  418  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  77.01 
 
 
266 aa  411  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  65.74 
 
 
267 aa  347  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  60.47 
 
 
263 aa  328  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  60 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  60.62 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  60.62 
 
 
265 aa  323  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  60 
 
 
265 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  56.98 
 
 
272 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  60 
 
 
267 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  56.59 
 
 
270 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  56.59 
 
 
272 aa  311  9e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  54.44 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  58.78 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  56.42 
 
 
272 aa  304  7e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  58.46 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  56.65 
 
 
268 aa  300  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  56.92 
 
 
267 aa  298  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  54.62 
 
 
268 aa  295  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  56.7 
 
 
265 aa  293  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  54.58 
 
 
264 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  54.02 
 
 
266 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  55.17 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  55.94 
 
 
267 aa  281  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  52.9 
 
 
261 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  52.51 
 
 
260 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  50.97 
 
 
260 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  52.69 
 
 
267 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  53.78 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  52.49 
 
 
265 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.74 
 
 
260 aa  227  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  45.74 
 
 
264 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  41.44 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.69 
 
 
265 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  42.19 
 
 
263 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.86 
 
 
267 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.06 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  38.65 
 
 
278 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  42.74 
 
 
253 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  43.1 
 
 
272 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  38.4 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.87 
 
 
267 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  38.29 
 
 
258 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  37.26 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  35.38 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  35.57 
 
 
266 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  36.13 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  34.14 
 
 
261 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  31.91 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  30.12 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  30.12 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  31.75 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  31.92 
 
 
291 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  30.12 
 
 
291 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  29.34 
 
 
291 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  29.34 
 
 
291 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  29.34 
 
 
291 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  29.34 
 
 
291 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  29.34 
 
 
291 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  30.12 
 
 
291 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  32.7 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  34.9 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  31.54 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  30.77 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  29.73 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  31.27 
 
 
292 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  30.77 
 
 
293 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  30.77 
 
 
293 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.32 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  31.03 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  29.89 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.5 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  30 
 
 
293 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  30.38 
 
 
293 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  30 
 
 
293 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30 
 
 
293 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.35 
 
 
279 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  27.82 
 
 
264 aa  115  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  27.71 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  31.15 
 
 
292 aa  112  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  30.83 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  32.97 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  31.01 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  30.53 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  28.04 
 
 
271 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  28.46 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  27.53 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.85 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.48 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  29.15 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>