122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3141 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 		 261 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  42.21 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  48.28 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  41.06 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  31.91 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  34.24 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  31.89 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  32.94 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  31.76 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  33.2 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  31.89 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  31.5 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  33.07 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  36.61 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  34.54 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  34.25 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  34.39 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  33.99 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.93 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  35.04 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  30.68 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  33.06 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  30.83 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  36.4 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  31.89 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  33.6 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  32.54 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  32.79 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.35 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.96 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  31.2 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  34.14 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  34.69 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  32.39 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.19 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  30.12 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.2 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  31.98 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  34.17 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.53 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  30 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  29.37 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  29.6 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  29.37 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  27.42 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  31.78 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.9 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  25.5 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  25.5 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.44 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.98 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  25 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  25 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  26.53 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  24.49 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  21.72 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  24.39 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  26.37 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  25.51 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  25.46 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  23.74 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  23.02 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  24.88 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  25.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  21.61 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  25 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  25.87 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  29.08 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  24.19 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  24.42 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  24.5 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  22.02 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.95 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.35 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  24.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  24.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  24.1 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  21.72 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  24.1 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  24.1 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  21.05 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  21.05 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  24.1 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  21.54 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  26.87 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  30.88 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  23.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  23.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  23.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  23.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  23.04 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  23.59 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  26.87 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>