181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3187 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  66.15 
 
 		 266 aa  363  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  62.31 
 
 		 263 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 		 265 aa  344  8e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  64.86 
 
 		 262 aa  342  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 		 265 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  61.78 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  59.39 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  57.98 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  58.58 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  56.7 
 
 		 272 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  59.47 
 
 		 267 aa  318  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  56.32 
 
 		 270 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  57.2 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  57.98 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  56.98 
 
 		 265 aa  309  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  55.17 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  52.87 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  54.55 
 
 		 267 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  55.94 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  58.24 
 
 		 265 aa  295  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  53.99 
 
 		 266 aa  291  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  52.83 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  53.52 
 
 		 260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  55.68 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  56.44 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  53.31 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  51.95 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  49.61 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  53.39 
 
 		 257 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  50.38 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  50.38 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  42.75 
 
 		 268 aa  221  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  43.85 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.08 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  42.08 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  43.63 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.37 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.77 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  38.89 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  41.04 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  41.74 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  38.33 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.77 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  37.74 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  35.16 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  36.84 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  34.47 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  35.74 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  36.12 
 
 		 272 aa  141  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  33.84 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  33.45 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  32.71 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  34.07 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  34.07 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  31.5 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  34.07 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  31.99 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  30.66 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  33.7 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  31.76 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  33.33 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  31.08 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  31.06 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  32.97 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  30.74 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  32.97 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  32.97 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  32.97 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  32.35 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  32.35 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  32.35 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  32.35 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  32.35 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  32.97 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  32.97 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  30.92 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30.98 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  30.65 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  30.65 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  33.08 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.13 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  30.3 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.12 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  30.52 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  29.89 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.92 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  30.3 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.94 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  29.96 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.57 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  30.08 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  28.52 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  26.34 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0369  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.01 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.71 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>