124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0399 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0399  aldolase  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  61.17 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  61.17 
 
 		 294 aa  367  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  60.34 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  64.73 
 
 		 295 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  60 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  61.17 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  59.66 
 
 		 293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  60.71 
 
 		 293 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  60.2 
 
 		 293 aa  359  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  58.97 
 
 		 293 aa  355  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  59.64 
 
 		 293 aa  354  8.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  61.46 
 
 		 295 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  58.13 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  58.13 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  58.39 
 
 		 291 aa  342  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  58.39 
 
 		 291 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  58.39 
 
 		 291 aa  342  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  58.39 
 
 		 291 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  58.39 
 
 		 291 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  58.04 
 
 		 291 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  57.69 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  57.73 
 
 		 291 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  57.73 
 
 		 291 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  57.39 
 
 		 291 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  56.99 
 
 		 292 aa  332  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  55.48 
 
 		 295 aa  331  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  49.23 
 
 		 331 aa  266  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  45.98 
 
 		 260 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  45.59 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  45.21 
 
 		 260 aa  249  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  38.74 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  38.98 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.18 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  35.57 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  34.55 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.99 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  32.95 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  33.08 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  33.08 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  31.25 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  32.95 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  30.66 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  32.81 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  32.54 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  32.45 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  31.3 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  31.66 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  30.53 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  32.02 
 
 		 272 aa  113  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.23 
 
 		 270 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  29.84 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  30.38 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  30.97 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  30.43 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  30.86 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  30.43 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  31.01 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  31.15 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  29.7 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  30.42 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  31.27 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  30.43 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  29.77 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  28.79 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  29.62 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  30.63 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  29.48 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  32.95 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  30.65 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  30.74 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  31.01 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.13 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  32.21 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  27.69 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  29.89 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  32.22 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  28.51 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  27.2 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  26.8 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.74 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.3 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.45 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  27.88 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>