179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3110 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  55.56 
 
 
266 aa  294  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  51.18 
 
 
261 aa  260  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  46.18 
 
 
265 aa  214  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  41.83 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  44 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  43.43 
 
 
267 aa  211  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  44.58 
 
 
267 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  43.78 
 
 
266 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  40.16 
 
 
272 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  39.76 
 
 
272 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  39.76 
 
 
270 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  40.56 
 
 
272 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  40.48 
 
 
261 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 
260 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  44.18 
 
 
267 aa  201  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  40.32 
 
 
271 aa  202  6e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  43.78 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  41.37 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  40.24 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  41.08 
 
 
268 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 
267 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  41.6 
 
 
260 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  39.76 
 
 
265 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  39.6 
 
 
268 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  39.6 
 
 
257 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  42.68 
 
 
267 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 
265 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  40.16 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  42 
 
 
262 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.41 
 
 
260 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  41.83 
 
 
263 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  41.49 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  41.74 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 
264 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  42.32 
 
 
265 aa  176  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.86 
 
 
265 aa  175  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  39.74 
 
 
272 aa  174  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.82 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  40.4 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.93 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  38.98 
 
 
263 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  39.2 
 
 
278 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  37.75 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  33.07 
 
 
267 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  32.77 
 
 
270 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  34.84 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38 
 
 
267 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  35.32 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  29.46 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  33.19 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  32.37 
 
 
280 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.51 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  31.03 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  32.05 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  28.85 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.98 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  28.4 
 
 
271 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  26.4 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  32.35 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  29.96 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  29.54 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  30.34 
 
 
260 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  29.91 
 
 
260 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  27.6 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  27.31 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  27.6 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  25.3 
 
 
293 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.1 
 
 
252 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.25 
 
 
279 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.88 
 
 
266 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  29.49 
 
 
260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  27.42 
 
 
293 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  26.61 
 
 
293 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  27.31 
 
 
292 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  27.02 
 
 
293 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.48 
 
 
266 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  29.41 
 
 
291 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  28.06 
 
 
291 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  27.02 
 
 
293 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  29.48 
 
 
293 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  28.06 
 
 
291 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  29.72 
 
 
293 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  27.42 
 
 
295 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.6 
 
 
295 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  27.42 
 
 
295 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  27.71 
 
 
294 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  26.48 
 
 
291 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  26.21 
 
 
292 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  28.06 
 
 
331 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  31.15 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  26.48 
 
 
291 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  26.48 
 
 
291 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>