131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2745 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  93.52 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  89.42 
 
 		 293 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  88.74 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  87.37 
 
 		 293 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  86.69 
 
 		 293 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  81.91 
 
 		 293 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  80.89 
 
 		 293 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  67.24 
 
 		 293 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  67.58 
 
 		 294 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  67.35 
 
 		 292 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  62.02 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  62.37 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  60.42 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  60.63 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  59.11 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  59.79 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  59.45 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  59.45 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  59.79 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  59.45 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  59.11 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  59.11 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  59.79 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  58.76 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  59.38 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  59.38 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  59.38 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  59.38 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  59.38 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  57.29 
 
 		 292 aa  359  4e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  58.13 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  50 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  39.92 
 
 		 260 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  39.16 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  36.43 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  34.87 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  30.15 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  29.57 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  31.25 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  33.2 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  33.2 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  31.03 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  29.57 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  30.8 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  31.64 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  31.92 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  30.19 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  30.62 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  30.77 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  31.42 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  30.74 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  29.48 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  31.03 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  30.74 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  26.83 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.71 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  30.83 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.63 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  29.37 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  29.39 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  30.38 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  30.23 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.08 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  32.57 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  30.62 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  30.8 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  31.5 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  30.34 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  30.92 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  29.76 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  31.23 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  27.6 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  30.22 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  29.18 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  29.06 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.73 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  30 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  28.09 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  27.2 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  26.67 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  27.5 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.79 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  27.97 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  27.6 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  30.6 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  25.51 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>