166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2070 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  100 
 
 		 272 aa  540  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  52.81 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  47.56 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  42.69 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  42.17 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  46.18 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  40.23 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  41.9 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  43.37 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  39.85 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  39.85 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  39.62 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  39.47 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  38.58 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  41.34 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  40.93 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  42.63 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  41.02 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  39.84 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  40.23 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  47.04 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  42.86 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.23 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  41.94 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  39.06 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  39.11 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  38.04 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  39.52 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  39.92 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  38.96 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  37.15 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  38.96 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  41.88 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  42.21 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  38.13 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  41.37 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  38.67 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  39.26 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.52 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  35.77 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.07 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  41.06 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.36 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  39.18 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.48 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  36.78 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  34.77 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  32.21 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  31.23 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  31.85 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.88 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  28.46 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  28.46 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  30.74 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  27.24 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.33 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  28.46 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.02 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.02 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  28.05 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  27.64 
 
 		 293 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  28.34 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  24.33 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  27.64 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  27.16 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  26.25 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  29.55 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  27.64 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  28.98 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  26.97 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  27.64 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  27.02 
 
 		 331 aa  92.4  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  25.73 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  27.52 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  27.57 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  27.57 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.35 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  27.46 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  27.16 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  26.75 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  30.33 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.09 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  27.16 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  27.16 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  26.34 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  26.56 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  26.27 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>