162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3502 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  55.56 
 
 		 253 aa  294  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  46.46 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  41.77 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  39.85 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  38.64 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  40.32 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  37.16 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  37.94 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  36.47 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  37.79 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  39.68 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  36.14 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  35.29 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  35.97 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  35.6 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  34.9 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  36.14 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  35.2 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  36.33 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  37.7 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.6 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  37.6 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  37.97 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  34.62 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  34.6 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  34.66 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  34.38 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  35.6 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  36.29 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.33 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  40 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  35.83 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  37.96 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  36.36 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  33.46 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  35.54 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  35.2 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  34.09 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  36.21 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  34.23 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  31.37 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.91 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  34.54 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  35.57 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  32.26 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  30.28 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.4 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  32.17 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  29.3 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  31.66 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  28.84 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  30.42 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  31.27 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  32.2 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.77 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  30.8 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  30.23 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  27.05 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  30.59 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  31.92 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.27 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  30.89 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.89 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  30.42 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  27.46 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  30.5 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  31.23 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  30.92 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  31.23 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  28.91 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  31.76 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  28.98 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  30.47 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  30.42 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  29.64 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  30.12 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30.04 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  31.2 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  31.27 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  30.12 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  30.12 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  31.15 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  29.64 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  30.89 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  32.21 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>