169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3085 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  44.06 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  43.68 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  41 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  41.38 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  42.58 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  41.09 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  42.23 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  39.53 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  39 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  39.53 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  38.61 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  38.61 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  41.09 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.23 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  41.02 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  39.77 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  40.96 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.34 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  38.22 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  38.22 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  41.86 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  37.94 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  39.53 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.55 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  39.46 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  36.96 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  40.46 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  38.55 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  39.52 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.3 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.79 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  41.04 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  39.25 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  40.87 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  38.37 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  38.06 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  41.49 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  36.5 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  39.48 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  37.3 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  40.32 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  37.11 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  34.4 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  32.06 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  31.01 
 
 		 270 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.2 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  29.76 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  30.8 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  29.77 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  30.89 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  29.32 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  34.21 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  28.46 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  27.76 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  29.73 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  29.73 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  27.89 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.25 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  29.23 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  28.96 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  28.68 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0369  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  29.07 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  29.07 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  28.52 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  27.91 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  27.46 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  28.24 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  28.74 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  27.84 
 
 		 260 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  27.91 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  27.91 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  27.91 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  27.52 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.43 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0886  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.69 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  27.63 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  27.43 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  28.19 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  29.34 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  28.19 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  26.09 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  27.52 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>