123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5219 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
266 aa  534  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  98.49 
 
 
266 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  37.12 
 
 
267 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  34.34 
 
 
267 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  33.58 
 
 
285 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  34.96 
 
 
270 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  34.85 
 
 
263 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  34.81 
 
 
265 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  34.21 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  34.34 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  32.96 
 
 
266 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  34.34 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 
268 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  33.84 
 
 
265 aa  137  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  31.46 
 
 
268 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  33.58 
 
 
270 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  33.58 
 
 
272 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  32.45 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  32.7 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  32.58 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  32.47 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  29.63 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.19 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.19 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  32.18 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  36.4 
 
 
264 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  33.09 
 
 
272 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  29.96 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  29.85 
 
 
265 aa  118  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.13 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  29.7 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  30.62 
 
 
266 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  29.17 
 
 
261 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  33.58 
 
 
268 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  33.09 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  31.44 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  31.27 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  32.21 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  30.5 
 
 
267 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  30.34 
 
 
272 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  29.88 
 
 
253 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  30.57 
 
 
265 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  28.9 
 
 
257 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  27.82 
 
 
260 aa  102  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  28.68 
 
 
271 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  29.48 
 
 
262 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  26.14 
 
 
260 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.74 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.27 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  28.68 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  28.69 
 
 
272 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  35.12 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.03 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  35.15 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  28.03 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1193  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.2 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  26.56 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  26.89 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  27.59 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3967  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.09 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0622201  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  29.89 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  27.8 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  28.19 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  27.8 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3078  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.88 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  28.19 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  27.8 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  30.77 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  27.03 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  27.03 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  27.03 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  27.65 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  27.17 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  28.9 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  30.22 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  28.57 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1960  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.26 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  28.9 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  30.22 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5160  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.5 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543239  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  32.93 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.25 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  34.15 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  26.35 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.43 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  28.46 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.63 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  27.41 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  32 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>