144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2373 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  49.25 
 
 
267 aa  240  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  46.18 
 
 
267 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  46.56 
 
 
270 aa  234  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  42.97 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  42.05 
 
 
266 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  44.11 
 
 
265 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  43.68 
 
 
271 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  41.22 
 
 
267 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  41.06 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  44.23 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  41.82 
 
 
268 aa  214  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  41.44 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
263 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  40.98 
 
 
263 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  44.53 
 
 
267 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  41.02 
 
 
268 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  42.63 
 
 
260 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  39.69 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  39.69 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  39.69 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  39.16 
 
 
267 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  42.63 
 
 
260 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 
272 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  40.67 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  44.4 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  37.4 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  43.25 
 
 
257 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  41.83 
 
 
261 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  36.64 
 
 
265 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  40.23 
 
 
265 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  40.98 
 
 
266 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  41.06 
 
 
262 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  36.76 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  37.15 
 
 
268 aa  178  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  36.82 
 
 
264 aa  178  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  38.8 
 
 
278 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.55 
 
 
267 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  42.13 
 
 
272 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  38.82 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  36.86 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.4 
 
 
260 aa  169  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.93 
 
 
267 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 
263 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  36.15 
 
 
261 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  33.46 
 
 
266 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  29.85 
 
 
267 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.93 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  32.95 
 
 
258 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  31.54 
 
 
270 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  27.44 
 
 
272 aa  116  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  29.43 
 
 
267 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.09 
 
 
279 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  29.02 
 
 
293 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  28.51 
 
 
280 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  27.91 
 
 
331 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
272 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  27.56 
 
 
293 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  27.73 
 
 
293 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  27.73 
 
 
293 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.74 
 
 
295 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  27.06 
 
 
293 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  27.89 
 
 
293 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  27.45 
 
 
293 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  24.73 
 
 
271 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.95 
 
 
266 aa  102  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  28.57 
 
 
293 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.95 
 
 
266 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  27.24 
 
 
292 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  26.85 
 
 
295 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  27.41 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  26.77 
 
 
293 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  27.2 
 
 
295 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.27 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  27.52 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  28.4 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  26.77 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  27.53 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  27.03 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  27.13 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  27.13 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  27.13 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  27.13 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  27.13 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  28.92 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>