169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4205 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  54.07 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  43.03 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  40.93 
 
 		 272 aa  225  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  40.31 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  38.64 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  39.02 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  38.64 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  39.61 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  43.02 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  39.45 
 
 		 265 aa  211  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6861  fructose-bisphosphate aldolase  46.98 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  41.8 
 
 		 267 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  44.06 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  37.85 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  42.53 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  38.82 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  39.56 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  43.41 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.62 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  38.04 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  39.06 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  40.87 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  40.3 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  40 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  39.36 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  37.64 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  38.19 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  39.37 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  37.75 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3141  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  42.21 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  38.4 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  37.1 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  38.8 
 
 		 267 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  38.65 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  38.02 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  35.16 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  39.6 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  40.73 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  39.2 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  39.92 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.11 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  39.77 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3502  fructose-bisphosphate aldolase  35.83 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2454  Fructose-bisphosphate aldolase  37.6 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  39.84 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  29.64 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  32.13 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  31.58 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  30.12 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  30.47 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  28.99 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  31.71 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  26.69 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.58 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  29.2 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  30.15 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  27.78 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  25.83 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  28.02 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  28.24 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  27.6 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  28.52 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  27.6 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  27.38 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  27.6 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  27.6 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  27.76 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  28 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  28.28 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  27.69 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  28.28 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  26.69 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  26.21 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.56 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.56 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  26.51 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  27.87 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  31.03 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  26.51 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  23.37 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  26.23 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  28.5 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  28.79 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  30.99 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  26.67 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  28.28 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  25.82 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  25.41 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  25.41 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>