126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1193 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1193  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 
278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233071  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3078  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  76.36 
 
 
280 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39201  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5160  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  74.91 
 
 
280 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543239  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  73.45 
 
 
280 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0369  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  69.37 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1960  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  65.7 
 
 
280 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  56.04 
 
 
283 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0265  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  50.55 
 
 
274 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0294  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.63 
 
 
274 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383352  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3967  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  47.73 
 
 
281 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0622201  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  30.36 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.239509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  30.63 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  32.04 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  32.13 
 
 
279 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  29.52 
 
 
268 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  31.39 
 
 
263 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  31.78 
 
 
265 aa  102  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  30.8 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.26 
 
 
265 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.74 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  31.65 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  29.24 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  28.31 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  28.31 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  30.37 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  27.44 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  28.95 
 
 
267 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  27.94 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  27.78 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  29.89 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  27.88 
 
 
268 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
263 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  29.08 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.1 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  27.8 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5219  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.2 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.639725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  30.8 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5482  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.2 
 
 
266 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  27.44 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.18 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  28.47 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  27.44 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  27.44 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  29.02 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  27.34 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  30.5 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  27.44 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  27.44 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  28.01 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  27.31 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  27.08 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  28.06 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  28.93 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  29.18 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  28.94 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  27.47 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  27.08 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  27.01 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.81 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  27.66 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  27.3 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  27.66 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  27.66 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2741  Fructose-bisphosphate aldolase  29.96 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.122813 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  30.29 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  27.66 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  27.66 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.9 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  27.3 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1606  aldolase  27.14 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  29.03 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  27.21 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  26.71 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  27.9 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  27.3 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  28.47 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  27.76 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  25.55 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  25.81 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3019  aldolase  26.45 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  26.62 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  28.11 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2745  aldolase  28.11 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  27.57 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  27.7 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  28.11 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  26.15 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  28.11 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  26.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  26.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  26.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  26.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  26.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1641  aldolase  28.83 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  29.35 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  28.01 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  28.36 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  27.07 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>