148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3858 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3858  cobalamin synthesis CobW domain protein  100 
 
 		 349 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0342119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3859  cobalamin synthesis CobW domain protein  58.52 
 
 		 350 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0885054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0158  cobalamin synthesis CobW domain protein  46.94 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36510  predicted GTPase, G3E family  44.69 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0288  cobalamin synthesis CobW domain protein  43.66 
 
 		 603 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.320141  normal  0.0218664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  39.89 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  28.89 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  30.68 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  27.59 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  28.9 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  21.67 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  22.96 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  21.91 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  21.36 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  21.36 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  21.36 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  21.67 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  21.36 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  24.11 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  28.34 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  21.1 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  29.26 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  23.25 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  23.56 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  23.32 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  23.77 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  21.88 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  24.45 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  24.37 
 
 		 408 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  24.27 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  24.14 
 
 		 406 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  26.34 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  27.3 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  24.28 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.75 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  25.44 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  24.27 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  22.26 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  23.41 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  23.08 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  25.77 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  26.44 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  25.56 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  23.19 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.87 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  26.38 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  23.58 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  25.95 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  26.37 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  25.09 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  22.03 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  19.03 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  25.57 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  23.91 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  23.14 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  23.19 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  23.69 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  22.32 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3252  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  21.49 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5488  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  26.77 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133332  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  25.41 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  21.7 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  22.56 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  23.99 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  23.9 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.22 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  23.06 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.22 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  24.05 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  23.32 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  24.72 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  24.05 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  23.86 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  24.34 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  23.79 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  24.25 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  24.72 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  25.09 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  24.31 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  23.5 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  24.92 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  23.86 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  24.81 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  24.72 
 
 		 424 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  22.68 
 
 		 402 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  24.4 
 
 		 436 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  23.8 
 
 		 437 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  22.61 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  22.61 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  25.3 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  22.37 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  23.21 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  24.36 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  25.78 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0399  cobalamin synthesis protein P47K  23.02 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414566  normal  0.973857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  21.45 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  21.54 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  23.51 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>