152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0288 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0288  cobalamin synthesis CobW domain protein  100 
 
 		 603 aa  1144    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.320141  normal  0.0218664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3858  cobalamin synthesis CobW domain protein  43.66 
 
 		 349 aa  237  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0342119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36510  predicted GTPase, G3E family  42.08 
 
 		 369 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0158  cobalamin synthesis CobW domain protein  41.82 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3859  cobalamin synthesis CobW domain protein  40.56 
 
 		 350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0885054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  37.29 
 
 		 397 aa  170  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  32.59 
 
 		 426 aa  99.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  32.59 
 
 		 427 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  27.95 
 
 		 404 aa  91.3  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  30.11 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  29.08 
 
 		 402 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  25.96 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  32.88 
 
 		 405 aa  87  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.6 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  35.79 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  26.42 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  27.13 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.5 
 
 		 408 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  28.41 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  28.72 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  27.15 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  27.31 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  28.85 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  27.95 
 
 		 410 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  29.08 
 
 		 400 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  25 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  26.81 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  27.5 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  26.81 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  25.25 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  27.07 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  26.95 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.37 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  26.58 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  27.41 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  28.3 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  27.07 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  26.5 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  27.41 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  29.67 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  26.5 
 
 		 402 aa  77  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  26.27 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  26.92 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  26.05 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  26.99 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  24.51 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  26.49 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  26.77 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  22.42 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  26.54 
 
 		 402 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  26.92 
 
 		 405 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.57 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  23.46 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  26.23 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3068  cobalamin synthesis protein P47K  29.27 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0294882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  28.35 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  29.01 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  22.74 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  23.97 
 
 		 423 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  23.05 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  23.05 
 
 		 395 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  31.18 
 
 		 422 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  26.87 
 
 		 401 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  25.81 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  23.05 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  26.56 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  27.64 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  28.01 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  25.61 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  27.65 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  26.32 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  22.19 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.69 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  26.43 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  28.35 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  27 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.38 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  26.3 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.38 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  27 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.71 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  26.54 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  26.05 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  25.48 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  25.19 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  22.57 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  26.25 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  24.23 
 
 		 395 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  26.33 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  25 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  27.97 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  27.27 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  27.27 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  26.64 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  26.5 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  26.28 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.15 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>