153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36510  predicted GTPase, G3E family  100 
 
 		 369 aa  718    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0158  cobalamin synthesis CobW domain protein  50.4 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3858  cobalamin synthesis CobW domain protein  44.69 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0342119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3859  cobalamin synthesis CobW domain protein  44.11 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0885054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0288  cobalamin synthesis CobW domain protein  42.08 
 
 		 603 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.320141  normal  0.0218664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  37.57 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 		 407 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  28.21 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  28.25 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  28.21 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  25.84 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  29.84 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  26.57 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  29.92 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  26.28 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  27.39 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  26.8 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  26.8 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  27.16 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  28.49 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  25.62 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  30.96 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  28.15 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  25.56 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  26.29 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  28.12 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.25 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.25 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  27.65 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  28.07 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  27.25 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  28.07 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  26.49 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.78 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.78 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  29.44 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.78 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.78 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  26.02 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  26.2 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  26.55 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.75 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  27.62 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  26.14 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  27.85 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  27.73 
 
 		 415 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.94 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  26.69 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  26.41 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  27.33 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  26.82 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  26.25 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  25.25 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  27.8 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  26.43 
 
 		 433 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  26.2 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  26.19 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  29.63 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  27.39 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  26 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  26 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  27.9 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  29.39 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  26.54 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  25.8 
 
 		 438 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  26.3 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  25 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  28.49 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  26.59 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  27.14 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  25.23 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  24.48 
 
 		 437 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.14 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  26.23 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  24.48 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  27.07 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.14 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  25.6 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  28.82 
 
 		 435 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  27.33 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  28.53 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  27.51 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  26.9 
 
 		 401 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  26.18 
 
 		 437 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  24.43 
 
 		 470 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  27.07 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  26.52 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  26.05 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  30.06 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  22.28 
 
 		 395 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  26.68 
 
 		 395 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  22.17 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  23 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  28.82 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  22.17 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  27.44 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  26.29 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  22.52 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>