197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4195 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  86.8 
 
 		 427 aa  690    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  100 
 
 		 426 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  72.6 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  54.5 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 		 540 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  33.67 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  33.01 
 
 		 438 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  30.5 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  31.15 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  32.71 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  32.93 
 
 		 402 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  33.1 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  29.78 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.24 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  32.44 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  28.79 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  34.47 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.82 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  26.57 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  34.1 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  31.17 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  30.2 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  33.5 
 
 		 435 aa  170  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.68 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  30.17 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.05 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  28.35 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  35.08 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  31.53 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  31.62 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  31.62 
 
 		 437 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  30.45 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.49 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.73 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.49 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  30.49 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  31.36 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.51 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 		 437 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.9 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  29.22 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  30.42 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  29.43 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  27.62 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.24 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  31.03 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  28.95 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  27.02 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  27.02 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  30.24 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  32.19 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  30.98 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  33.69 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.69 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  31.58 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  30.94 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.39 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.69 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4416  cobalamin synthesis CobW domain protein  38.42 
 
 		 363 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.53 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  31.85 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  30.52 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  30.41 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  30.41 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  31.29 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  28.5 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  30.71 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  33.66 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  29.63 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.95 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  31.12 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  30.52 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  30.56 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  30.05 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  29.32 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  30 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.8 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  27.07 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  29.45 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  27.8 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  27.07 
 
 		 527 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  26.54 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  29.21 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  27.43 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>