176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3290 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  100 
 
 		 405 aa  773    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  46.51 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  46.51 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  46.51 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1469  cobalamin synthesis CobW domain protein  50.37 
 
 		 442 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.097532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10107  hypothetical protein  45.96 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5332  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  46.6 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5488  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  43.52 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133332  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1313  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  41.49 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.736544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4416  cobalamin synthesis CobW domain protein  46.45 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  34.38 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  32.19 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  34.84 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  32.11 
 
 		 436 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  29.8 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  31.6 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  30.56 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  30.56 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  30.2 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  29.68 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.67 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.58 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  27.83 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.3 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  26.04 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  26.04 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  31.67 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  26.19 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  30.27 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  32.29 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  28.12 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  27.16 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  28.05 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  29.22 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  29.74 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  28.32 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  28.33 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  26.49 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  26.76 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  26.76 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  27.87 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  24.82 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  28.31 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  27.63 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  29.74 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  24.82 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  24.82 
 
 		 395 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.56 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  28.44 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  24.82 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  28.08 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.66 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  25.42 
 
 		 527 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  27.41 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  24.69 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  27.01 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  24.33 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  27.66 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.9 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.66 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  29.13 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  26.56 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  24.94 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  27.96 
 
 		 438 aa  99.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  26.54 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.42 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  27.19 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  28.2 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  26.65 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  27.43 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  28.2 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  28.2 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  26.23 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  27.34 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  27.71 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  29.2 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  26.39 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.2 
 
 		 519 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  27.49 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  34.27 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  28.04 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  26.16 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  30.06 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  26.51 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  28.35 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  28.96 
 
 		 406 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  29.95 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.8 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  28.4 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  24.06 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  26.97 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.92 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.92 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  27.37 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>