195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5332 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5332  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  63.75 
 
 
395 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  63.75 
 
 
395 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  63.75 
 
 
395 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10107  hypothetical protein  57.29 
 
 
398 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5488  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  55.28 
 
 
373 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133332  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1313  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  47.72 
 
 
370 aa  315  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.736544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  46.6 
 
 
405 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1469  cobalamin synthesis CobW domain protein  42.76 
 
 
442 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.097532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4416  cobalamin synthesis CobW domain protein  43.85 
 
 
363 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  31.19 
 
 
416 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.33 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  30.81 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  36.47 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  31.41 
 
 
417 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  34.83 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  30.06 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.25 
 
 
403 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  30.08 
 
 
438 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  29.53 
 
 
402 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  29.53 
 
 
423 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  29.53 
 
 
423 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  32.65 
 
 
406 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 
433 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.58 
 
 
519 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  31.07 
 
 
540 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  29.53 
 
 
438 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  32.03 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.43 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  30.67 
 
 
436 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 
436 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  27.07 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30.6 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  29.83 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  26.63 
 
 
395 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  26.67 
 
 
395 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  29.46 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  25 
 
 
395 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  26.13 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  26.63 
 
 
395 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.33 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  30.43 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.29 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.43 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  25.25 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  29.58 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  26.63 
 
 
527 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  29.19 
 
 
401 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  27.65 
 
 
407 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 
410 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.89 
 
 
402 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  27.18 
 
 
415 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  26.38 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  29.6 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  26.55 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  26.55 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.53 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.46 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  29.81 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.53 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.46 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.54 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  28.93 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 
435 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  25.85 
 
 
399 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  29.74 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  29.03 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  29.97 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  29.7 
 
 
401 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 
415 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  27.72 
 
 
401 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  29.43 
 
 
396 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  29.84 
 
 
437 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  29.84 
 
 
437 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  28.33 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  29.84 
 
 
470 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  27.59 
 
 
407 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  29.4 
 
 
400 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  30.23 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.89 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  31.3 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  29.19 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  28.82 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  29.3 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  29.7 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  30.09 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.04 
 
 
436 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 
410 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  29.03 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  24.86 
 
 
400 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  28.74 
 
 
402 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  27.94 
 
 
406 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  29.43 
 
 
400 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  27.3 
 
 
403 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  28.08 
 
 
441 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>