207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5488 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5488  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  733    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133332  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1313  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  70.24 
 
 		 370 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.736544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10107  hypothetical protein  62.1 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  55.26 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  55.26 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  55.26 
 
 		 395 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5332  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  55.28 
 
 		 405 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  43.52 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1469  cobalamin synthesis CobW domain protein  43.77 
 
 		 442 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.097532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4416  cobalamin synthesis CobW domain protein  44.54 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00259515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  35.15 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.28 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  29.49 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.83 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.61 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.15 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.35 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 		 397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.33 
 
 		 436 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.41 
 
 		 519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  25.36 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  25.36 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  31.2 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  29.14 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  30.29 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  29.78 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.9 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  25.57 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  27.43 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  27.43 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.98 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  27.43 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  25.83 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  25.93 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  27.18 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  29.71 
 
 		 446 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  25.94 
 
 		 395 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  27.72 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  25.83 
 
 		 527 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  25 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.54 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  31.63 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.71 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.64 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  29.63 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  27.59 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  29.47 
 
 		 446 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  25.65 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  30.87 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  25.5 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.47 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  27.7 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  28.54 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  25.28 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  28.11 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  29.07 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  29.23 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  26.42 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  27.59 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  28.19 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  29.14 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.01 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.01 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  26.13 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  30.11 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  26.91 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  27.59 
 
 		 415 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.17 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  27.25 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  25.85 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  27.59 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  29.3 
 
 		 436 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  28.29 
 
 		 401 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  26.65 
 
 		 402 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  28.61 
 
 		 410 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  28.69 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  29.3 
 
 		 436 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  29.89 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  27.4 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  27.91 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.08 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  28.1 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  29.56 
 
 		 540 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  26.45 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  27.96 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.94 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  27.03 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>