137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3859 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3859  cobalamin synthesis CobW domain protein  100 
 
 		 350 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0885054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3858  cobalamin synthesis CobW domain protein  58.52 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0342119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36510  predicted GTPase, G3E family  44.11 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0158  cobalamin synthesis CobW domain protein  44.48 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0288  cobalamin synthesis CobW domain protein  41.97 
 
 		 603 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.320141  normal  0.0218664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4161  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  33.88 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  23 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  22.69 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  22.39 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  25.97 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  23.91 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  29.48 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  22.39 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  23.34 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  23.77 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  22.39 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  22.69 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  22.44 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  25.3 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  23.15 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  21.19 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  26.97 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  24.57 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  22.55 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  22.39 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  26.54 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  23.56 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  25.3 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  23.16 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  23.86 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  25.97 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  25.95 
 
 		 392 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  25.86 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  23.23 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  24.22 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  25.6 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  25.6 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  25.6 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  24.85 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  27.41 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  23.37 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  26.14 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5655  cobalamin synthesis protein/P47K  23.98 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  24.2 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  24.74 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  23.98 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  25.44 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  25.29 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  25 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  25.28 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  23.8 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  23.75 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  28.57 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  24.4 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  22.35 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  27.6 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  24.81 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  24.15 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  23.97 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  22.06 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  23.08 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  25.41 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  25 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5526  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  22.87 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  25.94 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  23.36 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2614  cobalamin synthesis protein P47K  24.05 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.729102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  23.05 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  24.45 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  25.38 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3252  hypothetical protein  24.79 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  23.42 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  22.29 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.67 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  24.53 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  23.36 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  23.42 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  21.9 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  21.9 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  20.62 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  24.28 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  26.27 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  23.12 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  24.51 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  23.94 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10107  hypothetical protein  26.52 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  25.93 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  21.93 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  25.65 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  25.65 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  25.7 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  25.78 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  23.1 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  24.06 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  23.1 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5117  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  25.65 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624454  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  23.78 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  23.1 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>