More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0946 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0946  uridylate kinase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  56.77 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  56.96 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  56.52 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  55.84 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  56.33 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  51.07 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  50.64 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  50.64 
 
 		 246 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  52.17 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  50.22 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  51.74 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  51.3 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  52.81 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  52.17 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  50.64 
 
 		 249 aa  248  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  54.98 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  50.43 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  53.27 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  54.03 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  54.03 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  54.03 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  52.27 
 
 		 241 aa  241  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  52.27 
 
 		 241 aa  241  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  50 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  48.71 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  48.93 
 
 		 244 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  53.59 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  50 
 
 		 235 aa  238  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  49.57 
 
 		 239 aa  237  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  51.89 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  50.89 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  50.45 
 
 		 240 aa  235  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  50 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  49.57 
 
 		 239 aa  234  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  55.45 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  47.39 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  48.93 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  49.15 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  50.45 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  50.23 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  50 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  49.36 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  54.76 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  47.86 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  54.21 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  50.95 
 
 		 239 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  49.78 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  52.31 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  46.67 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  52.13 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  46.58 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  53.33 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  48.05 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  48.05 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  49.15 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  50.94 
 
 		 237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  50.94 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  48.26 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  46.96 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  51.16 
 
 		 242 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  46.98 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  50 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  47.77 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  48.66 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  50.24 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  45.96 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  46.96 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  50.24 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  46.4 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  46.96 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  47.32 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  50 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  47.96 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  50 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  48.36 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  47.83 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  45.95 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  49.77 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  46.15 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  50.48 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  47.32 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  48.65 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  53.74 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  45.05 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  49.06 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  46.12 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  48.2 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  48.58 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  46.45 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  47.32 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  45.69 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  44.64 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  49.53 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  48.02 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  52.34 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  49.76 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  48.42 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  49.76 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  47.96 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>