More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2860 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 940 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4861  isoleucyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 1004 aa  1317    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 940 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0519  isoleucyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 963 aa  1181    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23114  normal  0.394026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 949 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 940 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0548  isoleucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 941 aa  648    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 940 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 919 aa  659    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2220  isoleucyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 989 aa  1388    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568466  normal  0.0664047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 951 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 972 aa  1156    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3235  isoleucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 940 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.489815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 908 aa  648    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 987 aa  1005    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 984 aa  1058    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0711  isoleucyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 937 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.573133  hitchhiker  0.00000334953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 937 aa  665    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0391  isoleucyl-tRNA synthetase  66.57 
 
 		 989 aa  1385    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386718  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5819  isoleucyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 987 aa  1168    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5384  isoleucyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 951 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 947 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 977 aa  1054    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0775  isoleucyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 937 aa  673    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 941 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 932 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 971 aa  1086    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 945 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.510866  hitchhiker  0.000115828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 929 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  62.81 
 
 		 999 aa  1332    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 972 aa  1156    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0028  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0184357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 969 aa  1203    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 940 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1798  isoleucyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 988 aa  1362    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 984 aa  1055    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 927 aa  714    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1458  isoleucyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 		 953 aa  644    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.551267 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 929 aa  679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 953 aa  860    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 934 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 946 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1291  isoleucyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 940 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326353  normal  0.133319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3032  isoleucyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 970 aa  1157    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622037  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 953 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 948 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 943 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 939 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 940 aa  974    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 920 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00029  hypothetical protein  38.63 
 
 		 938 aa  659    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00165877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0580  isoleucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 952 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0642875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 1054 aa  1315    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 968 aa  834    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  50.05 
 
 		 992 aa  989    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 975 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 1024 aa  1320    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 934 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0508  isoleucyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 936 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 943 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 1001 aa  1298    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 965 aa  1144    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 		 999 aa  1329    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 938 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2602  isoleucyl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 991 aa  1403    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  0.0934177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2207  isoleucyl-tRNA synthetase  63.57 
 
 		 1012 aa  1295    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.307981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 936 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 974 aa  986    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 1063 aa  850    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2325  isoleucyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 991 aa  1400    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48374  normal  0.697637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0474  isoleucyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 963 aa  1185    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 985 aa  1162    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2860  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1071 aa  2185    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 940 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 940 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 940 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 940 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 943 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 931 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 990 aa  981    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1006  isoleucyl-tRNA synthetase  71.44 
 
 		 1001 aa  1519    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1933  isoleucyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 991 aa  1014    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.183113  hitchhiker  0.00000504744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 		 999 aa  1339    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2735  isoleucyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 951 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 924 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 940 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2280  isoleucyl-tRNA synthetase  65.45 
 
 		 993 aa  1405    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.601181  normal  0.314996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4057  isoleucyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 969 aa  994    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 936 aa  644    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 928 aa  721    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 946 aa  669    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 940 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1411  isoleucyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 972 aa  849    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.556917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0385  isoleucyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 938 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00152699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>