More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4038 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 959 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 938 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 938 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 987 aa  1038    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 923 aa  769    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 943 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 916 aa  649    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 939 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 960 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 921 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 953 aa  690    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 945 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 946 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 972 aa  1199    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 940 aa  706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 943 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 921 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 921 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 953 aa  648    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 921 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 945 aa  663    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 931 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 940 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 945 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 938 aa  711    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 943 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 941 aa  676    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 932 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 945 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 974 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 944 aa  674    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 929 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  81.26 
 
 		 999 aa  1694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 943 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 945 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 977 aa  1047    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 940 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 943 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 984 aa  1053    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 927 aa  736    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 945 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  52.85 
 
 		 984 aa  1057    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 940 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 923 aa  773    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 934 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 943 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 921 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 945 aa  663    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 951 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 945 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 943 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 944 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 940 aa  977    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 930 aa  715    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 945 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 946 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  83.78 
 
 		 1054 aa  1800    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 968 aa  821    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 924 aa  788    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 992 aa  982    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 975 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 932 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  82.71 
 
 		 1024 aa  1734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 934 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 949 aa  703    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 943 aa  690    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 940 aa  717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1001 aa  2061    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 946 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  83.45 
 
 		 999 aa  1726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 947 aa  683    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 959 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 938 aa  689    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 936 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 974 aa  1014    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 1063 aa  794    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 945 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 942 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 985 aa  1202    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 937 aa  714    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 940 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 940 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 941 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 943 aa  699    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 927 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 990 aa  978    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 945 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 943 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 948 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 971 aa  1134    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 940 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 945 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 941 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 945 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 939 aa  693    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 928 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 954 aa  788    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 940 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 931 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>