More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2885 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 959 aa  1174    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 938 aa  961    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 938 aa  959    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 924 aa  775    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 923 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 943 aa  1096    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 916 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 939 aa  939    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  83.12 
 
 		 960 aa  1693    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 921 aa  727    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 953 aa  936    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  70.28 
 
 		 945 aa  1421    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 1370 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 940 aa  949    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 940 aa  931    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 943 aa  1105    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 921 aa  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 921 aa  730    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  59.94 
 
 		 951 aa  1201    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 921 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  70.28 
 
 		 945 aa  1421    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0963  isoleucyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 967 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 931 aa  929    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 931 aa  931    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 938 aa  768    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  56.98 
 
 		 943 aa  1113    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 941 aa  938    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 932 aa  1121    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 		 946 aa  1194    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  90.13 
 
 		 974 aa  1826    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 944 aa  937    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 929 aa  1121    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 999 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 978 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  70.28 
 
 		 945 aa  1424    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0334  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 973 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.765747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 940 aa  953    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 943 aa  1090    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 984 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 927 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 945 aa  1430    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 973 aa  655    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 974 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 923 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 934 aa  759    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 943 aa  903    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 921 aa  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1869  isoleucyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 967 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478653  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0415  isoleucyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 989 aa  832    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 954 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 943 aa  1084    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 944 aa  1181    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 940 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 930 aa  730    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  71.12 
 
 		 945 aa  1438    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 946 aa  720    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1783  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 973 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 968 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 987 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 960 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 975 aa  1182    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 932 aa  927    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 1024 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 934 aa  1067    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 943 aa  1187    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  73.1 
 
 		 945 aa  1454    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 943 aa  914    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 940 aa  936    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 1001 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 946 aa  1059    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 931 aa  736    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 947 aa  955    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 959 aa  1994    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 938 aa  872    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 936 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 974 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 984 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 945 aa  1432    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 942 aa  946    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0227  isoleucyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 967 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 937 aa  925    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  70.28 
 
 		 945 aa  1421    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 940 aa  937    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 940 aa  935    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 941 aa  928    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 943 aa  927    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 927 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 990 aa  644    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  70.59 
 
 		 945 aa  1428    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 943 aa  1087    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 932 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 941 aa  944    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 944 aa  649    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 945 aa  1145    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 945 aa  1424    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 945 aa  1432    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 939 aa  910    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 928 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 954 aa  748    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 940 aa  934    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>