More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4182 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 959 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 940 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 938 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 938 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 923 aa  756    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 943 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 953 aa  820    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 939 aa  701    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 953 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 921 aa  676    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 953 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 945 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 941 aa  683    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 972 aa  1192    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 940 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 943 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 921 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 921 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 951 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 921 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 949 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 940 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 938 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 943 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 941 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 942 aa  839    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 945 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 974 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 929 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  79.64 
 
 		 999 aa  1734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 924 aa  758    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 945 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 984 aa  1048    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 940 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 943 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 984 aa  1047    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 927 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 931 aa  696    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 940 aa  701    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 923 aa  751    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 934 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 943 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 921 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 940 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 948 aa  703    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 943 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 944 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 940 aa  957    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 930 aa  695    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 945 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 946 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1054 aa  2169    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 968 aa  803    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 939 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 		 992 aa  987    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 946 aa  674    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 932 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  80.49 
 
 		 1024 aa  1747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 943 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 943 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 943 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  83.78 
 
 		 1001 aa  1800    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  80.7 
 
 		 999 aa  1755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  80.88 
 
 		 999 aa  1754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 947 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 969 aa  1194    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 938 aa  686    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 936 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 974 aa  991    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 1063 aa  771    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 945 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 942 aa  701    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 985 aa  1177    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 937 aa  720    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 972 aa  1189    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 940 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 940 aa  694    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 941 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 943 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 927 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 990 aa  983    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 945 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 943 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 977 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 971 aa  1132    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 931 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 946 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 945 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 928 aa  750    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 954 aa  781    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 940 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 924 aa  761    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 987 aa  1031    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 944 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>