More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3046 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  75.87 
 
 		 959 aa  1470    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 938 aa  920    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 938 aa  919    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 924 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 923 aa  798    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 943 aa  1112    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 916 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 939 aa  917    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2458  isoleucyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 960 aa  1198    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 921 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 953 aa  889    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 945 aa  1217    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0227  isoleucyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 967 aa  858    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.376879  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 972 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 940 aa  960    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 943 aa  1113    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 921 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 921 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0415  isoleucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 989 aa  847    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.686118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 921 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 945 aa  1217    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0963  isoleucyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 967 aa  858    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 931 aa  919    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 931 aa  920    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 938 aa  783    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 943 aa  1121    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 941 aa  933    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 932 aa  1090    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2109  isoleucyl-tRNA synthetase  73.56 
 
 		 945 aa  1452    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2745  isoleucyl-tRNA synthetase  61.67 
 
 		 974 aa  1202    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 944 aa  900    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 929 aa  1082    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 999 aa  680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 978 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 945 aa  1217    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0334  isoleucyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 973 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.765747  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 940 aa  907    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 943 aa  1117    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 984 aa  692    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 927 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 945 aa  1223    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 973 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 974 aa  665    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 923 aa  801    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 934 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 943 aa  885    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 921 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 919 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  74.53 
 
 		 951 aa  1481    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 954 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 943 aa  1070    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 		 944 aa  1454    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 940 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 930 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  63.59 
 
 		 945 aa  1231    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 946 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 1054 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 968 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 987 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 992 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  74.63 
 
 		 975 aa  1470    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 932 aa  935    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 1024 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 934 aa  983    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  74.87 
 
 		 943 aa  1471    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 945 aa  1223    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 943 aa  954    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 940 aa  944    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 1001 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 946 aa  1105    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 999 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 947 aa  947    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 959 aa  1207    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 938 aa  883    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 936 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 974 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 1063 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 945 aa  1222    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 942 aa  932    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 937 aa  887    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 946 aa  1946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 940 aa  968    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 940 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 941 aa  904    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 943 aa  960    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 927 aa  736    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 990 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 945 aa  1218    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 943 aa  1088    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 932 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 941 aa  897    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 944 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 1370 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 929 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  62.87 
 
 		 945 aa  1222    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 939 aa  876    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 928 aa  809    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 954 aa  754    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 940 aa  967    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0610  isoleucyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 916 aa  653    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000217018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>