More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1798 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
959 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
938 aa  693    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
938 aa  693    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
924 aa  763    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
923 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
943 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
916 aa  650    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
939 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
953 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
921 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
953 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
917 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 
972 aa  1169    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 
972 aa  1171    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
940 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
943 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
921 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
921 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
953 aa  890    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
921 aa  684    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
919 aa  652    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
931 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
931 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
931 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
938 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
943 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
941 aa  673    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
932 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
931 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
924 aa  758    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
940 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
929 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  65.35 
 
 
999 aa  1303    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 
978 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
942 aa  871    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
940 aa  681    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
940 aa  698    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
943 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
984 aa  1075    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
927 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
945 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
948 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 
977 aa  1078    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
923 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
934 aa  681    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
969 aa  1192    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
921 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
940 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
943 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
954 aa  640    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
943 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
951 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
940 aa  1027    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 
930 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
945 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
960 aa  647    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 
1054 aa  1278    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
968 aa  852    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
944 aa  675    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
992 aa  1052    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
975 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
932 aa  684    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
1024 aa  1289    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
934 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
946 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
940 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
943 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 
987 aa  1056    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 
1001 aa  1279    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
908 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 
999 aa  1300    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
947 aa  676    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 
999 aa  1322    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
938 aa  674    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
936 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 
974 aa  1066    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
1063 aa  843    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
917 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
942 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 
985 aa  1128    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
937 aa  689    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
1152 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
940 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
940 aa  690    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
941 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
943 aa  684    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
927 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 
990 aa  1074    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
945 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
943 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
943 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
949 aa  696    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
984 aa  1077    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 
971 aa  1128    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
941 aa  697    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
943 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
939 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
928 aa  758    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
954 aa  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
940 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>