More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0412 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 913 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 938 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 938 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 987 aa  1060    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 923 aa  739    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 943 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 916 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 939 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 947 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 921 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 953 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 940 aa  678    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 948 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  76.96 
 
 		 972 aa  1540    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 940 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 938 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 921 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 921 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 951 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 921 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 946 aa  655    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 917 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 953 aa  896    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 940 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 938 aa  676    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 943 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 941 aa  667    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 932 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 943 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 921 aa  683    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 944 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 929 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 999 aa  1256    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 978 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 919 aa  655    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  69.88 
 
 		 971 aa  1416    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 940 aa  668    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 943 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 984 aa  1062    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 927 aa  725    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 942 aa  933    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 940 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 969 aa  1996    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 923 aa  744    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 934 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 943 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 921 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 943 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 944 aa  661    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 917 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 943 aa  678    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 908 aa  684    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 940 aa  1023    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 930 aa  726    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3032  isoleucyl-tRNA synthetase  78.24 
 
 		 970 aa  1551    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 		 1054 aa  1194    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 968 aa  883    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 940 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 992 aa  1015    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 975 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 932 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  62.49 
 
 		 1024 aa  1231    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 934 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 943 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  76.96 
 
 		 972 aa  1540    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 943 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 924 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 1001 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 946 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 999 aa  1214    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 947 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2885  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 959 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.461357  normal  0.170399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 938 aa  641    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 		 977 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 974 aa  1024    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 1063 aa  840    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 949 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 942 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  74.92 
 
 		 985 aa  1529    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 937 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 1152 aa  635    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 940 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 940 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 941 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 943 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 927 aa  727    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 990 aa  1032    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 		 999 aa  1225    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 943 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 931 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 941 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 940 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 931 aa  704    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 940 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 924 aa  732    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 939 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 928 aa  736    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 954 aa  794    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 940 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 984 aa  1062    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>