More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0391 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 938 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 938 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 938 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 923 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 913 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 916 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 939 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 948 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 921 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 953 aa  671    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 938 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 931 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0202  isoleucyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 		 972 aa  1143    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.315539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 940 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 943 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 921 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 921 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 946 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 921 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 999 aa  1328    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2221  isoleucyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 984 aa  1101    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.5724  normal  0.944921 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 931 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  59.96 
 
 		 965 aa  1175    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 940 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 943 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 941 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 960 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 917 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 943 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 940 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 929 aa  678    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2542  isoleucyl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 999 aa  1316    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 978 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 949 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 940 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 940 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3032  isoleucyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 970 aa  1152    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622037  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0568  isoleucyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 984 aa  1100    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 927 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 917 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 943 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1740  isoleucyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 953 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 923 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 934 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 943 aa  643    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 921 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 931 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 940 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0499  isoleucyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 977 aa  1097    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 943 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 951 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 940 aa  1062    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 930 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 921 aa  699    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 946 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4182  isoleucyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 		 1054 aa  1288    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3259  isoleucyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 968 aa  847    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.412172  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 944 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3467  isoleucyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 992 aa  1066    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0639262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 975 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 932 aa  653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1395  isoleucyl-tRNA synthetase  64.38 
 
 		 1024 aa  1303    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.320728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 934 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 940 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 919 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 943 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 987 aa  1053    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4038  isoleucyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 1001 aa  1294    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.270009  normal  0.410472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 946 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3162  isoleucyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 999 aa  1311    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 947 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 908 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 938 aa  666    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 936 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2389  isoleucyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 974 aa  1072    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2357  isoleucyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 1063 aa  875    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 924 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 942 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0425  isoleucyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 985 aa  1153    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 937 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 947 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 940 aa  672    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 940 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 941 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 943 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 927 aa  693    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0613  isoleucyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 990 aa  1075    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 969 aa  1202    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 943 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 942 aa  885    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 944 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 953 aa  914    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 971 aa  1130    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 941 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 972 aa  1141    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 939 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 928 aa  753    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 954 aa  779    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 940 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 940 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>