39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0937 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0937  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 380 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0199625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  62.84 
 
 		 386 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  21.65 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.95 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  21.28 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.73 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  25.7 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  31.17 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.91 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  19.33 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  22.03 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  24.62 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  22.16 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  24.58 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  24.36 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  21.54 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>