More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0863 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0863  protein kinase  100 
 
 
493 aa  997    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807143  normal  0.632306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0922  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
635 aa  237  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1797  protein kinase  35.57 
 
 
790 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.530576  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0329  protein kinase  35.37 
 
 
819 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0108  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0833  protein kinase  29.39 
 
 
650 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0945  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.89 
 
 
669 aa  123  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.299328  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1102  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1132  protein kinase  28.74 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.538051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  28.63 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0059  protein kinase  28.85 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.339419  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0056  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0129993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 
752 aa  70.1  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.81 
 
 
764 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  35.37 
 
 
1922 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
645 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
586 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
713 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.78 
 
 
880 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  26.92 
 
 
1110 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6424  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
1280 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.328261  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
573 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
328 aa  65.1  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
678 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
691 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
711 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
761 aa  63.9  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1771  protein kinase  34.48 
 
 
425 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
605 aa  63.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0025  protein kinase  28.46 
 
 
368 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.57 
 
 
668 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1282  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0542753  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2408  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
290 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.155652  hitchhiker  0.00744313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
456 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.16 
 
 
896 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.27 
 
 
682 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.66 
 
 
986 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3725  protein kinase  31.65 
 
 
1028 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
512 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6196  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1414 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.84 
 
 
854 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
430 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4035  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
295 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
430 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.79 
 
 
598 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
431 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  25.1 
 
 
1376 aa  60.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  26.44 
 
 
672 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
464 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 
870 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2878  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
626 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  25.72 
 
 
1053 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.21 
 
 
613 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.78 
 
 
911 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5270  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
496 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0454  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.4 
 
 
618 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  25.19 
 
 
372 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.19 
 
 
662 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.91 
 
 
664 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  34.25 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  27.31 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
700 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  26.32 
 
 
889 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
685 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
614 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
623 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  26.51 
 
 
623 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.36 
 
 
477 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  26.51 
 
 
621 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.46 
 
 
742 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1281  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.140436  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.21 
 
 
1655 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1333 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28119  Suppressor of Sensor Kinase (SLN1)  29.81 
 
 
1425 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.56 
 
 
693 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.46 
 
 
943 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.51 
 
 
601 aa  57.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
708 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2563  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000933415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 
639 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 
639 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  20.87 
 
 
623 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.88 
 
 
841 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
683 aa  57  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3956  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
613 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  23.85 
 
 
715 aa  57  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.58 
 
 
1774 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1872  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
534 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.589962  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  22.99 
 
 
1430 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
664 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3287  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
940 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.092483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>