More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1797 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1797  protein kinase  100 
 
 
790 aa  1587    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.530576  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0329  protein kinase  51.04 
 
 
819 aa  357  6.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0108  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
554 aa  230  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0922  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
635 aa  229  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0863  protein kinase  35.57 
 
 
493 aa  196  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807143  normal  0.632306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0945  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.29 
 
 
669 aa  152  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.299328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0833  protein kinase  30.18 
 
 
650 aa  143  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1132  protein kinase  28.66 
 
 
528 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.538051 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0056  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
483 aa  95.1  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0129993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1102  serine/threonine protein kinase  25.07 
 
 
484 aa  89.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0025  protein kinase  25.59 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0059  protein kinase  24.85 
 
 
358 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.339419  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1600  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
562 aa  68.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000058478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
645 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.07 
 
 
602 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.31 
 
 
598 aa  61.6  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
596 aa  58.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.07 
 
 
764 aa  58.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
439 aa  57.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0122  serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 
457 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0828115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0125  serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 
457 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  29.07 
 
 
544 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_16032  predicted protein  37.11 
 
 
422 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732203  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.74 
 
 
707 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
473 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
500 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
683 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1875  predicted protein  24.68 
 
 
353 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
646 aa  56.6  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.87 
 
 
660 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  27.06 
 
 
445 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  25.4 
 
 
660 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
551 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
615 aa  55.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
700 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
380 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1808  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
564 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
581 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1606  serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 
561 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
752 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.49 
 
 
911 aa  54.3  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
546 aa  54.3  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
435 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.47 
 
 
666 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
715 aa  54.3  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4665  protein kinase  26.36 
 
 
307 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
721 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
777 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
510 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
512 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.97 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.14 
 
 
662 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
610 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
1430 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 
678 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
430 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1997  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.22 
 
 
696 aa  53.5  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  24.48 
 
 
403 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 
431 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
771 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1671  protein kinase  26.69 
 
 
301 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  23.6 
 
 
569 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
538 aa  52  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
565 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 
752 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6424  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
1280 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.328261  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.55 
 
 
676 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1709  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
672 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0316412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
613 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  29.75 
 
 
462 aa  52.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.14 
 
 
584 aa  52.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.53 
 
 
591 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
465 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3584  Serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
545 aa  51.6  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
476 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  27.7 
 
 
1057 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  26.97 
 
 
774 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44716  predicted protein  25.42 
 
 
1108 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 
413 aa  51.2  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.66 
 
 
540 aa  51.2  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
641 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
483 aa  50.8  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.86 
 
 
1044 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.77 
 
 
676 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
335 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1122 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
556 aa  50.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0464  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 
582 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
464 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
554 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
625 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0097  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
675 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255203  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.1 
 
 
477 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  29.29 
 
 
589 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 
746 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_20073  predicted protein  23.67 
 
 
260 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.542202  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89641  predicted protein  25.52 
 
 
546 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.42 
 
 
551 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1473  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.13 
 
 
747 aa  50.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0818047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>