More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0329 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0329  protein kinase  100 
 
 
819 aa  1642    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1797  protein kinase  51.04 
 
 
790 aa  365  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.530576  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0108  serine/threonine protein kinase  43.84 
 
 
554 aa  251  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0922  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
635 aa  229  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0863  protein kinase  35.37 
 
 
493 aa  194  7e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.807143  normal  0.632306 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0945  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.44 
 
 
669 aa  146  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.299328  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0833  protein kinase  30.74 
 
 
650 aa  137  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1102  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 
484 aa  103  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1132  protein kinase  30.04 
 
 
528 aa  96.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.538051 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0056  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
483 aa  90.5  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0129993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0059  protein kinase  25 
 
 
358 aa  90.1  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.339419  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0025  protein kinase  29.94 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.72 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
615 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.06 
 
 
446 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  27.38 
 
 
544 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 
519 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  25.39 
 
 
1053 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
343 aa  61.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 
602 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 
500 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  23.69 
 
 
1057 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3584  Serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 
545 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0130417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  25.61 
 
 
672 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14702  predicted protein  27.45 
 
 
273 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.2995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 
562 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  23.41 
 
 
589 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
1430 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  27.65 
 
 
335 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59677  predicted protein  23.11 
 
 
440 aa  56.6  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
335 aa  55.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
322 aa  55.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
380 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
473 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 
855 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  23 
 
 
721 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
707 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1322  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
1003 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.39 
 
 
540 aa  55.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.11 
 
 
676 aa  54.7  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
602 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
719 aa  54.3  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.86 
 
 
641 aa  54.3  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
360 aa  54.3  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.6 
 
 
593 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
777 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_2845  predicted protein  21.33 
 
 
268 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
758 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
646 aa  53.9  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  26.8 
 
 
625 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 
770 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  26.8 
 
 
625 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88482  predicted protein  29.23 
 
 
468 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606682  normal  0.147074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
531 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 
737 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
503 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
610 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
338 aa  53.5  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  26.67 
 
 
509 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
673 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
292 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5076  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
431 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.12 
 
 
591 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10893  predicted protein  24.89 
 
 
276 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866021  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  24.39 
 
 
982 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1818  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.1 
 
 
1287 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.118707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 
338 aa  52  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.63 
 
 
499 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1282  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
517 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0542753  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  26.85 
 
 
340 aa  52  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1535  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.38 
 
 
515 aa  52  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
716 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 
543 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
1009 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
660 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30.18 
 
 
1009 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.33 
 
 
993 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.04 
 
 
551 aa  51.6  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
464 aa  51.2  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0122  serine/threonine protein kinase  21.68 
 
 
457 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0828115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
557 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
340 aa  51.2  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 
538 aa  51.2  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  30.18 
 
 
1017 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  30.87 
 
 
399 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0125  serine/threonine protein kinase  21.68 
 
 
457 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
752 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
556 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.52 
 
 
930 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2378  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
661 aa  50.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.74 
 
 
1036 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  22.63 
 
 
545 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.69 
 
 
728 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  24.81 
 
 
451 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4415  predicted protein  35.85 
 
 
266 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.080472  normal  0.353466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  22.77 
 
 
341 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
691 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 
624 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>