More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3725 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3725  protein kinase  100 
 
 		 1028 aa  2112    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 706 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 1415 aa  135  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.28 
 
 		 1023 aa  135  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.99 
 
 		 584 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 		 627 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.04 
 
 		 757 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.28 
 
 		 943 aa  128  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 455 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 537 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.5 
 
 		 798 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 938 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2186  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.58 
 
 		 610 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 707 aa  126  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 891 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.71 
 
 		 520 aa  125  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 		 468 aa  125  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.23 
 
 		 863 aa  124  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.59 
 
 		 880 aa  124  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 700 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.77 
 
 		 916 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  34.63 
 
 		 458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.85 
 
 		 551 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 613 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 571 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 919 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  30.62 
 
 		 462 aa  122  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.03 
 
 		 769 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  33.82 
 
 		 574 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  37.2 
 
 		 599 aa  122  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 533 aa  121  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 763 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 1122 aa  121  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 		 894 aa  121  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.14 
 
 		 1044 aa  121  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 618 aa  121  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.47 
 
 		 1373 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.3 
 
 		 746 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 624 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.65 
 
 		 1655 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 624 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.7 
 
 		 986 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 624 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.36 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.89 
 
 		 841 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.84 
 
 		 1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 632 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  31.34 
 
 		 457 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 1085 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.73 
 
 		 621 aa  119  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.3 
 
 		 626 aa  119  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.73 
 
 		 598 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  31.8 
 
 		 618 aa  118  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 		 569 aa  118  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.41 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 646 aa  117  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.11 
 
 		 715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  32.32 
 
 		 1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  30.9 
 
 		 494 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.78 
 
 		 668 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 601 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  31.82 
 
 		 561 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 		 554 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 411 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  33.46 
 
 		 1032 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.18 
 
 		 1856 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 		 597 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.35 
 
 		 1019 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  32.75 
 
 		 1053 aa  116  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.16 
 
 		 896 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 790 aa  116  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4058  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.229235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 888 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.33 
 
 		 889 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32 
 
 		 593 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.6 
 
 		 653 aa  115  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  30.89 
 
 		 583 aa  115  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.03 
 
 		 511 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.48 
 
 		 664 aa  114  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 915 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 464 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  30.74 
 
 		 586 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.37 
 
 		 668 aa  114  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.88 
 
 		 602 aa  114  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  31.96 
 
 		 615 aa  114  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.27 
 
 		 635 aa  114  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.96 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  30.37 
 
 		 488 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 985 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.62 
 
 		 586 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.75 
 
 		 822 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.1 
 
 		 681 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  27.59 
 
 		 625 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 1479 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>