130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2814 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2814  peptidase M24  100 
 
 
334 aa  672    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0747512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2396  peptidase M24  63.8 
 
 
336 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4109  peptidase M24  44.21 
 
 
363 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4018  peptidase M24  44.21 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2151  peptidase M24  40.73 
 
 
371 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20650  peptidase M24  31.75 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1037  hypothetical protein  41.21 
 
 
359 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3134  hypothetical protein  38.44 
 
 
370 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1227  peptidase M24  33.62 
 
 
363 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0637  peptidase M24  35.34 
 
 
384 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1639  hypothetical protein  34.37 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.264137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2259  hypothetical protein  33.05 
 
 
365 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.0091596  normal  0.541812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3332  hypothetical protein  36.79 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2092  peptidase M24  33.14 
 
 
367 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0301  hypothetical protein  30.17 
 
 
367 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.274341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0767  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  30.66 
 
 
419 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2629  peptidase M24  32.31 
 
 
366 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4451  peptidase M24  32.96 
 
 
381 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4491  peptidase M24  30.68 
 
 
367 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.146146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0431  hypothetical protein  34.3 
 
 
392 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3231  hypothetical protein  21.53 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.91034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.36 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  26.36 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  26.74 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.36 
 
 
365 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.36 
 
 
365 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  26.36 
 
 
365 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.36 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.74 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  26.36 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  23.72 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  26.36 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.97 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  23.53 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.21 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  29.29 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  28.78 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  30.32 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.74 
 
 
364 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  22.99 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.05 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.79 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  26.9 
 
 
380 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  26.9 
 
 
380 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  24.4 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  26.9 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  27.36 
 
 
369 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  30.17 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.15 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.15 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  33.1 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  32.39 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5777  aminopeptidase  28 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149254  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  23.62 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  25.84 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.07 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  25.33 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  22.67 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  26.67 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  26.18 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  25.13 
 
 
375 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  28 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  24.33 
 
 
437 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  32.39 
 
 
268 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  32.39 
 
 
268 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  32.39 
 
 
268 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  31.69 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  31.69 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  25 
 
 
438 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  25 
 
 
438 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  25.99 
 
 
393 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  25.98 
 
 
441 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  25.97 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  29.5 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  28.57 
 
 
418 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  24.89 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  25.11 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  25.98 
 
 
441 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  24.24 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  24.24 
 
 
438 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  24.24 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  22.38 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  25.3 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  24.54 
 
 
414 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  25.74 
 
 
443 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  27.52 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0519  peptidase M24  20.54 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  27.52 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  29.25 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  25.98 
 
 
441 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.63 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  29.49 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  29.49 
 
 
272 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  26.01 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>