39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4018 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4109  peptidase M24  95.32 
 
 		 363 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4018  peptidase M24  100 
 
 		 363 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2151  peptidase M24  51.63 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1037  hypothetical protein  43.7 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2814  peptidase M24  44.21 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0747512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2396  peptidase M24  40.9 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1227  peptidase M24  34.29 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3134  hypothetical protein  34.25 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20650  peptidase M24  31.61 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0301  hypothetical protein  31.61 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.274341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3332  hypothetical protein  33.94 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1639  hypothetical protein  34.55 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.264137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2092  peptidase M24  34.41 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2629  peptidase M24  27.64 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2259  hypothetical protein  31.45 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.0091596  normal  0.541812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0767  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  31.49 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4491  peptidase M24  31.25 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.146146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0637  peptidase M24  30.79 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4451  peptidase M24  33.43 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0431  hypothetical protein  32.62 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3231  hypothetical protein  22.98 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.91034  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  30.57 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  29.61 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2862  peptidase M24  27.8 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25.98 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  26.81 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.11 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.11 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.66 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.11 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.11 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  28.74 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  29.23 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.11 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0936  peptidase M24  28.29 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.66 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.66 
 
 		 365 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  23.79 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  29.02 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>