More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2862 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2862  peptidase M24  100 
 
 
386 aa  757    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1328  peptidase M24  47.15 
 
 
390 aa  296  5e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.690062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1619  peptidase M24  41.88 
 
 
441 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2642  peptidase M24  47.88 
 
 
400 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.715902  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1427  peptidase M24  44.85 
 
 
396 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0500  peptidase M24  45.5 
 
 
392 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3486  peptidase M24  42.11 
 
 
381 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2391  peptidase M24  42.71 
 
 
396 aa  266  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1315  Xaa-Pro dipeptidase (cobalt-dependent)  40.58 
 
 
389 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1239  peptidase M24  39.79 
 
 
383 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.862796  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2585  peptidase M24  42.31 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1268  hypothetical protein  38.26 
 
 
377 aa  227  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.59904  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0936  peptidase M24  38.93 
 
 
391 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134106  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2340  peptidase M24  37.43 
 
 
376 aa  220  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2373  peptidase M24  42.28 
 
 
380 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.800187  normal  0.111506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2091  peptidase M24  38.92 
 
 
376 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0488  peptidase M24  37.27 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0202  peptidase M24  37.79 
 
 
432 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.736579 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4052  peptidase M24  34.2 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  36.34 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  38.32 
 
 
357 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  33.83 
 
 
354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.04 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  32.26 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  43.48 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  30.97 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  35.79 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  33.33 
 
 
358 aa  130  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  33.1 
 
 
353 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  33.7 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  33.45 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0616  peptidase M24  36.4 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886156  normal  0.0599138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  32.74 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  32.74 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  43.65 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  27.86 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  31.39 
 
 
357 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  35.06 
 
 
359 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  33.09 
 
 
353 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  33.09 
 
 
353 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  40.11 
 
 
363 aa  126  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  42.08 
 
 
358 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  30.16 
 
 
353 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  34.66 
 
 
371 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  31.65 
 
 
357 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  31.13 
 
 
352 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.65 
 
 
356 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  33.21 
 
 
358 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  29.58 
 
 
353 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  36.46 
 
 
369 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  42.65 
 
 
348 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  32.84 
 
 
358 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  27.37 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  33.97 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  44.75 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  41.85 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  32.4 
 
 
361 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0547  peptidase M24  33.46 
 
 
441 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  39.02 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  33.87 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  35.21 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  32.57 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  33.85 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  32.5 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  38.28 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  36.79 
 
 
362 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  29.66 
 
 
353 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  33.58 
 
 
376 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  32.43 
 
 
357 aa  116  7.999999999999999e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  34.65 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.46 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  33.09 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.46 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  35.9 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  33.81 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  30.19 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  34.04 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  38.1 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  39.56 
 
 
366 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  30.08 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  26.22 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0728  Fis family transcriptional regulator  39.56 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  41.57 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  32.68 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  32.82 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  32.82 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.31 
 
 
364 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  41.18 
 
 
366 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  33.58 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  33.45 
 
 
361 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  35.21 
 
 
373 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  33.45 
 
 
361 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  36.65 
 
 
364 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  34.49 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>