More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0616 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0616  peptidase M24  100 
 
 
408 aa  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886156  normal  0.0599138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0547  peptidase M24  89.93 
 
 
441 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2642  peptidase M24  35.82 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.715902  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1328  peptidase M24  36.2 
 
 
390 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.690062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0500  peptidase M24  37.93 
 
 
392 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2391  peptidase M24  37.27 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2585  peptidase M24  31.69 
 
 
375 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1427  peptidase M24  39.06 
 
 
396 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1619  peptidase M24  35.8 
 
 
441 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0488  peptidase M24  34.21 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3486  peptidase M24  36.96 
 
 
381 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2091  peptidase M24  34.05 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1315  Xaa-Pro dipeptidase (cobalt-dependent)  35.02 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1268  hypothetical protein  37.17 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.59904  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2862  peptidase M24  36.4 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1239  peptidase M24  31.82 
 
 
383 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.862796  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2340  peptidase M24  30.11 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.29 
 
 
347 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2373  peptidase M24  38.05 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.800187  normal  0.111506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  32.95 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  31.44 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  30.42 
 
 
356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  33.33 
 
 
353 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
356 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  31.46 
 
 
356 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  30.42 
 
 
356 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  30.08 
 
 
356 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  30.42 
 
 
356 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  28.63 
 
 
354 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  30.42 
 
 
356 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.18 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4052  peptidase M24  31.64 
 
 
389 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  31.09 
 
 
356 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  30.42 
 
 
356 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  30.42 
 
 
353 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0202  peptidase M24  36.15 
 
 
432 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.736579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  30.8 
 
 
353 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  32.33 
 
 
356 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  32.09 
 
 
353 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  38.42 
 
 
348 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  30.22 
 
 
353 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  30.22 
 
 
353 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  30.65 
 
 
376 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  38.59 
 
 
356 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  34.43 
 
 
376 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.65 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  30.12 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  30.2 
 
 
323 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  28.94 
 
 
364 aa  96.3  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  31.3 
 
 
357 aa  96.3  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.78 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  24.39 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  34.88 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  27.41 
 
 
362 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  30.7 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  32.05 
 
 
357 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  35.48 
 
 
371 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  25.61 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  28.35 
 
 
359 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  35.79 
 
 
369 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  36.41 
 
 
364 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  31.56 
 
 
388 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  32.1 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  27.57 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  29.7 
 
 
359 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  27.34 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  30.08 
 
 
359 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.72 
 
 
351 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  36.17 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3224  aminopeptidase P  29.7 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.72 
 
 
351 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  32.08 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  29.02 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  32.2 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.57 
 
 
348 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  30.1 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  26.57 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  29.93 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.22 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.59 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0936  peptidase M24  35 
 
 
391 aa  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134106  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.59 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  38.42 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  30.71 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  31.09 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  35.48 
 
 
356 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  34.78 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  29.21 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  28.68 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  26.74 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.39 
 
 
376 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>