More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0547 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0616  peptidase M24  89.93 
 
 		 408 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.886156  normal  0.0599138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0547  peptidase M24  100 
 
 		 441 aa  898    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2642  peptidase M24  33.43 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.715902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0488  peptidase M24  34.96 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2585  peptidase M24  33.33 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2391  peptidase M24  37.04 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1427  peptidase M24  38.28 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1328  peptidase M24  36.33 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.690062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1619  peptidase M24  35.41 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1268  hypothetical protein  31.15 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.59904  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0500  peptidase M24  35.17 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1239  peptidase M24  32.87 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.862796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2091  peptidase M24  35.13 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1315  Xaa-Pro dipeptidase (cobalt-dependent)  35.63 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3486  peptidase M24  35.02 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2862  peptidase M24  33.46 
 
 		 386 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2373  peptidase M24  34.69 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.800187  normal  0.111506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2340  peptidase M24  28.23 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4052  peptidase M24  32.38 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  30.86 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  30.3 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0202  peptidase M24  36.36 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.736579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  30.22 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.26 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  30.6 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  31.25 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  30.22 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  30.6 
 
 		 356 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0936  peptidase M24  33.77 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  30.6 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  30.6 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  32.06 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  31.6 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  37.37 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  38.04 
 
 		 356 aa  97.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  35.68 
 
 		 367 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  37.43 
 
 		 353 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  29.85 
 
 		 356 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  30.68 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  37.56 
 
 		 358 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  35.83 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  35.83 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.48 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.48 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  30.04 
 
 		 323 aa  93.2  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  36.36 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.11 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  35.29 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  29.15 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  37.3 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  30.15 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  30.6 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.07 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  29.25 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  31.06 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  32.97 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.57 
 
 		 358 aa  90.1  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  26.42 
 
 		 347 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  23.47 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  31.18 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  33.82 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  33.33 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  29.57 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  26.6 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  35.33 
 
 		 364 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1205  peptidase M24  24.83 
 
 		 351 aa  87.8  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.24 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.24 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  28.95 
 
 		 351 aa  87  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.96 
 
 		 359 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3224  aminopeptidase P  29.7 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  29.8 
 
 		 369 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  31.37 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  32.26 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  31.31 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  26.52 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  30.35 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  33.51 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  35.18 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  34.41 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  26.08 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  32.83 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.86 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.43 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  35.96 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  29.51 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.34 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  27.3 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  34.39 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  27.3 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  26.44 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  33.09 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>