58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4109 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4109  peptidase M24  100 
 
 
363 aa  728    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4018  peptidase M24  95.32 
 
 
363 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2151  peptidase M24  52.17 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1037  hypothetical protein  43.42 
 
 
359 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2814  peptidase M24  44.21 
 
 
334 aa  242  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0747512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2396  peptidase M24  41.52 
 
 
336 aa  225  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1227  peptidase M24  33.24 
 
 
363 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20650  peptidase M24  32.57 
 
 
361 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3134  hypothetical protein  35.17 
 
 
370 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3332  hypothetical protein  34.56 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0301  hypothetical protein  30.95 
 
 
367 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.274341  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1639  hypothetical protein  34.55 
 
 
373 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.264137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2092  peptidase M24  34.71 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0767  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  31.64 
 
 
419 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2629  peptidase M24  28.57 
 
 
366 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2259  hypothetical protein  29.97 
 
 
365 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.0091596  normal  0.541812 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4491  peptidase M24  31.16 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.146146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0637  peptidase M24  31.69 
 
 
384 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4451  peptidase M24  34.29 
 
 
381 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0431  hypothetical protein  32.93 
 
 
392 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3231  hypothetical protein  23.65 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.91034  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  31.06 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  29.95 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.81 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  25.73 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2862  peptidase M24  30.94 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.69 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  31.54 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  25.23 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.69 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.69 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.69 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  27.66 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  30.36 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.23 
 
 
365 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.69 
 
 
365 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.76 
 
 
347 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2391  peptidase M24  29.63 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  29.57 
 
 
416 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.23 
 
 
365 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1268  hypothetical protein  27.91 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.59904  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  24.42 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  22.7 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  24.14 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.35 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.23 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  28.14 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.65 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  26.09 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.31 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.77 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0936  peptidase M24  27.78 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0134106  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  26.41 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1315  Xaa-Pro dipeptidase (cobalt-dependent)  26.92 
 
 
389 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  28.77 
 
 
356 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  27.91 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  30.2 
 
 
358 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  23.49 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>