26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6090 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6090  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 938 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 		 940 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  23.36 
 
 		 984 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  23.36 
 
 		 984 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  32.38 
 
 		 711 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 961 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 983 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  24.87 
 
 		 980 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.99 
 
 		 726 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 		 651 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 968 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 		 724 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 1067 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 964 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.88 
 
 		 637 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 		 712 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  23.64 
 
 		 980 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 553 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 796 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  21.82 
 
 		 781 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 1055 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  21.72 
 
 		 973 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 		 643 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  27.46 
 
 		 1056 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>